不明熱の治療は、確定診断を付けることが第一です。初期検査として血液検査（CBC、生化学）、胸部X線、検尿および血液培養検査を行います。これら検査結果と医療面接・診察所見より問題点を整理し、鑑別診断を挙げ、必要に応じて追加検査を実施し、最終診断を導き出します。治療は診断に応じて速やかに開始され、診断によっては他の診療科と共同、あるいは依頼することもあります。高齢者では感染症を起こしても発熱は軽微になる傾向があることもあるため、症例に応じた柔軟な対応が求められます。

体重減少の確定診断のために最も重要なのは、「医療面接」です。エネルギーの摂取不足か過剰使用かを病態生理学的に見極めた上で、初期検査として血液検査（CBC、生化学、内分泌検査）、胸部X線、検尿などを行います。鑑別診断から必要に応じて追加検査を実施し、最終診断を導き出します。確定診断後は、疾患に応じた専門治療を必要とすることが多く、他診療科や他職種へのコンサルテーションが重要です。

リンパ節腫脹の確定診断のために最も重要なのは、「医療面接・診察」です。リンパ節腫脹の経過やリンパ節の性状を踏まえ、局在性か全身性かを判断し、初期検査として血液検査（CBC、生化学、ウイルス抗体価、自己抗体、可溶性IL-2Rなど）、胸部X線、腹部超音波検査などを行います。最終診断のために、リンパ節の組織検査が必要な場合もあります（特に腫瘍性が考えられる場合）。確定診断後、腫瘍性では専門治療を必要とすることが多く、他診療科との連携が重要です。

両疾患共に治療は確立され、B型慢性肝炎では核酸アナログ製剤、C型慢性肝炎では直接型抗ウイルス剤（DAA）が使用されます。いずれも経口剤で副作用も少なく、安全に治療を遂行することが可能です。B型肝炎に対する核酸アナログ製剤は、ほぼ生涯にわたる継続的な内服治療が必要ですが、C型肝炎に対するDAA治療は、僅か8-12週間の治療で95%以上の確率でC型肝炎ウイルス排除が可能です。これらの抗ウイルス治療により、肝がんや肝硬変への進展を抑止できることが数多く報告されています。

3剤以上の抗HIV薬を組み合わせて服用する多剤併用療法（ART）が、今日のHIV感染症の標準治療法です。従来の核酸系逆転写酵素阻害剤（NRTI）、非核酸系逆転写酵素阻害剤（NNRTI）、プロテアーゼ阻害剤に加え、インテグラー阻害剤やCCR5阻害剤が実用化されています。ART導入時期は感染が判明し次第、可及的速やかに開始することが推奨されています。合剤が一般化され1日1-2錠治療も可能となり、重篤な副作用も少ないことから、治療の成功率は飛躍的に向上しています。